Tous les blocs claviers sont doté de 14 boutons paramétrables destinés à piloter le combinateur de Hauptwerk : ajusteur, annulateur, séquenceur - et +, boutons de 0 à 9 ; à partir de deux claviers, 6 boutons supplémentaires sont placés entre les claviers I et II, destinés à appeler tirasses et accouplements.